Η Lucasfilm τελικά εξήγησε πώς λειτούργησε πραγματικά το Order 66 – και γιατί ορισμένοι από τους κλώνους στρατιώτες μπόρεσαν να του αντισταθούν. Ο Πάλπατιν σχεδίασε τους Κλώνους ως την απόλυτη παγίδα των Τζεντάι, επειδή οι Τζεντάι έχασαν αμέσως μόλις επέλεξαν να ξεκινήσουν πόλεμο.
Αλλά το Order 66 ήταν ο απόλυτος θρίαμβος του Πάλπατιν, καθώς – σε όλο τον γαλαξία – οι κλώνοι στρατιώτες στράφηκαν εναντίον των Στρατηγών Τζεντάι που τους διοικούσαν. Το Star Wars: The Clone Wars εξήγησε γιατί ακόμη και ηρωικοί κλώνοι είχαν πυροβολήσει τους Τζεντάι, αποκαλύπτοντας ότι όλοι οι κλώνοι που δημιουργήθηκαν από τους Καμινανούς είχαν τσιπ αναστολέα που τους αφαιρούσαν την ελεύθερη βούληση.
Η Lucasfilm αποκάλυψε τελικά γιατί τα τσιπ αναστολέα ήταν τόσο αποτελεσματικά και γιατί ορισμένοι κλώνοι μπόρεσαν να αντισταθούν στο Order 66. O πίνακας εκδόσεων της Lucasfilm στο San Diego Comic Con 2023 παρουσίασε εικόνες από το επερχόμενο βιβλίο Dawn of Rebellion: The Visual Guide και το κείμενο αποκαλύπτει την αληθινή φύση του Order 66 – και γιατί ο Πάλπατιν ενοχλήθηκε τόσο πολύ όταν κάποιοι κλώνοι του αντιστάθηκαν.
“Το μυστικό όπλο της εντολής Order 66, κωδικοποιημένο στη γενετική σύνθεση κάθε κλώνου, χρειαζόταν πλήρη, ομοιόμορφη υποτέλεια για να λειτουργήσει. Όταν ήρθε η ώρα, η εκτέλεση της διαταγής πέτυχε σε μεγάλο βαθμό, αλλά υπήρξαν μερικοί κλώνοι με ισχυρό μυαλό που αντιστάθηκαν.“
Το Order 66, φαίνεται, κωδικοποιήθηκε σε γενετικό επίπεδο. Ωστόσο, όσο πιο ατομικιστής γινόταν ένας κλώνος, τόσο περισσότερο του αντιστέκονταν. Αυτό εξηγεί γιατί ο Captain Rex κατάφερε να αντισταθεί στο να σκοτώσει την Ahsoka Tano στη 7η σεζόν του Star Wars: The Clone Wars.